圣吉米尼亚诺以圣徒吉米尼亚诺为名,建于第三世纪。据说圣徒吉米尼亚诺造出一片浓雾,拯救摩德纳市免于阿提拉与匈奴人的攻击。这个城市从十世纪开始,就成为前往罗马的朝圣路线上的一站,也因此开始发展起来。
1199年,在居民变得富有之后,圣吉米尼亚诺即脱离伏泰拉主教,开始自治。城里各种高塔都是富有居民竞相炫富的结果。全盛时期曾同时拥有72座塔。
但是1348年的瘟疫使圣吉米尼亚诺受到重创。在没有金钱的维持下,这个城市开始瓦解。议会向佛罗伦萨求援后,随即由佛罗伦萨接管。