Gli Assassini sono color che lottano per garantire la sopravvivenza del libero arbitrio e della libertà. Combattono una guerra segreta contro i Templari dall'alba dei tempi, per impedire che essi domino il mondo e che si impossessino dei Frutti dell'Eden, manufatti della Prima Civilizzazione, una specie molto avanzata vissuta nella Preistoria che creò gli uomini.