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La Citerne Basilique est la représentation virtuelle d'une mémoire génétique d'Ezio Auditore da Firenze, revécue en 2012 par Desmond Miles à travers l'Animus.
Description
Ezio pénétra dans la Citerne Basilique, reliée à l'ancienne boutique des Polo par un passage secret.
Dialogue
Ezio glissa jusque dans la citerne.
- Garde 1: Ti distihia ! (Misère !) Tu sais depuis combien de temps on fouille ce bassin répugnant ?
- Garde 2: Je suis là depuis des semaines.
- Garde 1: Treize mois ! Depuis que le Grand Maître a trouvé cette clé maudite. Mais il ne sait pas du tout où chercher. Tout ce qu'il sait, c'est qu'elles sont quelque part dans la ville.
- Garde 2: Et elle est tellement grande...
- Garde 1: To xèro ! (Je sais !) C'est bien ce que je dis.
- Capitaine 1: Retournez à vos postes, bons à rien !

Ezio accédant au premier site de fouilles
Ezio arriva sur le premier site de fouilles.
- Garde 3: Quelle puanteur, là-dedans. Nous trouverons bientôt les clés.
- Capitaine 1: Du nerf, toi ! On te paye pour monter la garde, pas pour dormir.
Ezio élimina le capitaine et récupéra sa clé, avec laquelle il ouvrit la grille menant au prochain site de fouilles.
- Garde 4: J'en ai assez de cet endroit. Vraiment.
- Garde 5: Huit heures dans cette puanteur. Apìstefto. (Incroyable.)
- Garde 6: Le Grand Maître a ses raisons. Mais j'aimerais bien les connaître.
Ezio arriva sur le deuxième site de fouilles.
- Capitaine 2: Petros ! Vérifie qu'on a assez de torches pour les fouilles. J'en ai assez de toujours trébucher dans le noir.
Ezio assassina le capitaine et lui prit sa clé. Une fois dans l'autre salle, il aperçut un garde lancé à sa recherche.
- Garde 7: Fouillez chaque recoin !
Ezio arriva sur le dernier site de fouilles.
- Capitaine 3: Il y a un intrus parmi nous. Ouvrez l'œil et soyez prêts à dégainer.
- Gardes: Envoyez des renforts ! On nous attaque !
C'était quoi, ça ?
Vous voyez quelque chose ?
Là-bas ! Dans le coin ! J'ai vu quelque chose.
Où est-il... ?
Oh non ! Il en sort de partout !
Après avoir identifié et tué le dernier capitaine des Templiers, Ezio récupéra sa clé. Il ouvrit ensuite la porte de la citerne, et localisa la chambre secrète dans laquelle était renfermée une clé de Masyaf grâce à son Sens de l'aigle.
Conséquences
Ezio s'empara de l'une des clés de la bibliothèque d'Altaïr Ibn-La'Ahad.