- «Aquí está el problema. Tu cerebro esta hecho picadillo. Demasiados fantasmas en la cabeza, demasiadas voces. Entonces, ¿cómo se arregla eso? Tendrás que abrirte paso hasta los datos guardados, buscar recuerdos inacabados, y acceder a ellos. Acaba lo empezado, hasta que tu antepasado no tenga nada mas que mostrarte. ESO es un nexo de sincronización.»
- ―Clay Kaczmarek a Desmond Miles
Un Nexo de Sincronización es el logro de una persona que ha experimentado completamente los recuerdos genéticos de uno o mas de sus antepasados, sin tener nada mas que observar. Permitió a una persona el acceso a la Nexus y era necesario evitar las duras consecuencias del efecto sangrado.
En 2012, después de recuperar la Manzana de Edén de Ezio Auditore, Desmond Miles cayó en coma. Puesto de nuevo en el Animus para mantener su conciencia, Desmond "despertó" en la Sala de Negro , el modo seguro del Animus, donde conoció a la representación visual del Animus, Tema Proyecto 16,Clay Kaczmarek.
Clay le dijo a Desmond finalmente que la única forma de escapar de la Sala Negra y el coma, era lograr un nexo de sincronización, la conclusión completa de la vida de sus antepasados, que estaban amenazando a sangrar de forma permanente en recuerdos de Desmond y su personalidad.
Desmond así comenzó a revivir los últimos recuerdos de su antepasado Ezio Auditore, en busca de las llaves Masyaf que, a su vez, le permiten revivir momentos clave en la vida de Altaïr Ibn-La'Ahad, otro antepasado suyo.
Al terminar estos recuerdos, Desmond logró un nexo de sincronización, y se detuvo en el Nexus. Una vez allí, Júpiter , miembro de la primera civilización , habló con él sobre elGran Templo , y el primer desastre .